Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNGAP1Q96PV0 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms