Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ0

SORCS2, VPS10 domain-containing receptor SorCS2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS2Q96PQ0 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms