Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE5

OPALIN, Opalin, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPALINQ96PE5 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms