Protein–RNA interactions for Protein: Q96NT0

CCDC115, Coiled-coil domain-containing protein 115, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC115Q96NT0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms