Protein–RNA interactions for Protein: Q96M42

LINC00479, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00479, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00479Q96M42 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
LINC00479Q96M42 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00479Q96M42 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms