Protein–RNA interactions for Protein: Q96KR7

PHACTR3, Phosphatase and actin regulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR3Q96KR7 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PHACTR3Q96KR7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PHACTR3Q96KR7 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PHACTR3Q96KR7 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PHACTR3Q96KR7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PHACTR3Q96KR7 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PHACTR3Q96KR7 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PHACTR3Q96KR7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PHACTR3Q96KR7 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PHACTR3Q96KR7 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PHACTR3Q96KR7 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PHACTR3Q96KR7 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PHACTR3Q96KR7 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PHACTR3Q96KR7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PHACTR3Q96KR7 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PHACTR3Q96KR7 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PHACTR3Q96KR7 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PHACTR3Q96KR7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PHACTR3Q96KR7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PHACTR3Q96KR7 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PHACTR3Q96KR7 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PHACTR3Q96KR7 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PHACTR3Q96KR7 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PHACTR3Q96KR7 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PHACTR3Q96KR7 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PHACTR3Q96KR7 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PHACTR3Q96KR7 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PHACTR3Q96KR7 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PHACTR3Q96KR7 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PHACTR3Q96KR7 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PHACTR3Q96KR7 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PHACTR3Q96KR7 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PHACTR3Q96KR7 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PHACTR3Q96KR7 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PHACTR3Q96KR7 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PHACTR3Q96KR7 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PHACTR3Q96KR7 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PHACTR3Q96KR7 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PHACTR3Q96KR7 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PHACTR3Q96KR7 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PHACTR3Q96KR7 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PHACTR3Q96KR7 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PHACTR3Q96KR7 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PHACTR3Q96KR7 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PHACTR3Q96KR7 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PHACTR3Q96KR7 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PHACTR3Q96KR7 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PHACTR3Q96KR7 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PHACTR3Q96KR7 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PHACTR3Q96KR7 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PHACTR3Q96KR7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PHACTR3Q96KR7 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PHACTR3Q96KR7 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PHACTR3Q96KR7 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC26.58■■□□□ 1.84
PHACTR3Q96KR7 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PHACTR3Q96KR7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PHACTR3Q96KR7 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PHACTR3Q96KR7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PHACTR3Q96KR7 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PHACTR3Q96KR7 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PHACTR3Q96KR7 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PHACTR3Q96KR7 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PHACTR3Q96KR7 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PHACTR3Q96KR7 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PHACTR3Q96KR7 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PHACTR3Q96KR7 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PHACTR3Q96KR7 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PHACTR3Q96KR7 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PHACTR3Q96KR7 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PHACTR3Q96KR7 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PHACTR3Q96KR7 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PHACTR3Q96KR7 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PHACTR3Q96KR7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PHACTR3Q96KR7 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PHACTR3Q96KR7 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PHACTR3Q96KR7 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PHACTR3Q96KR7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PHACTR3Q96KR7 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PHACTR3Q96KR7 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PHACTR3Q96KR7 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PHACTR3Q96KR7 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PHACTR3Q96KR7 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PHACTR3Q96KR7 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PHACTR3Q96KR7 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PHACTR3Q96KR7 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PHACTR3Q96KR7 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PHACTR3Q96KR7 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PHACTR3Q96KR7 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PHACTR3Q96KR7 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PHACTR3Q96KR7 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PHACTR3Q96KR7 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PHACTR3Q96KR7 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PHACTR3Q96KR7 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PHACTR3Q96KR7 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PHACTR3Q96KR7 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PHACTR3Q96KR7 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PHACTR3Q96KR7 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PHACTR3Q96KR7 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PHACTR3Q96KR7 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PHACTR3Q96KR7 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms