Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
LRRIQ1Q96JM4 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
LRRIQ1Q96JM4 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
LRRIQ1Q96JM4 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
LRRIQ1Q96JM4 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
LRRIQ1Q96JM4 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
LRRIQ1Q96JM4 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
LRRIQ1Q96JM4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
LRRIQ1Q96JM4 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
LRRIQ1Q96JM4 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
LRRIQ1Q96JM4 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
LRRIQ1Q96JM4 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
LRRIQ1Q96JM4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
LRRIQ1Q96JM4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
LRRIQ1Q96JM4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
LRRIQ1Q96JM4 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
LRRIQ1Q96JM4 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
LRRIQ1Q96JM4 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
LRRIQ1Q96JM4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
LRRIQ1Q96JM4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
LRRIQ1Q96JM4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
LRRIQ1Q96JM4 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
LRRIQ1Q96JM4 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
LRRIQ1Q96JM4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
LRRIQ1Q96JM4 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
LRRIQ1Q96JM4 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
LRRIQ1Q96JM4 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
LRRIQ1Q96JM4 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
LRRIQ1Q96JM4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
LRRIQ1Q96JM4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
LRRIQ1Q96JM4 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
LRRIQ1Q96JM4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC31.54■■■□□ 2.64
LRRIQ1Q96JM4 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
LRRIQ1Q96JM4 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
LRRIQ1Q96JM4 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
LRRIQ1Q96JM4 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
LRRIQ1Q96JM4 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
LRRIQ1Q96JM4 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
LRRIQ1Q96JM4 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
LRRIQ1Q96JM4 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
LRRIQ1Q96JM4 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
LRRIQ1Q96JM4 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
LRRIQ1Q96JM4 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
LRRIQ1Q96JM4 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
LRRIQ1Q96JM4 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
LRRIQ1Q96JM4 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
LRRIQ1Q96JM4 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
LRRIQ1Q96JM4 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
LRRIQ1Q96JM4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
LRRIQ1Q96JM4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
LRRIQ1Q96JM4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
LRRIQ1Q96JM4 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
LRRIQ1Q96JM4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
LRRIQ1Q96JM4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
LRRIQ1Q96JM4 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
LRRIQ1Q96JM4 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
LRRIQ1Q96JM4 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
LRRIQ1Q96JM4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
LRRIQ1Q96JM4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
LRRIQ1Q96JM4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
LRRIQ1Q96JM4 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
LRRIQ1Q96JM4 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
LRRIQ1Q96JM4 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
LRRIQ1Q96JM4 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
LRRIQ1Q96JM4 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
LRRIQ1Q96JM4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
LRRIQ1Q96JM4 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
LRRIQ1Q96JM4 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC31.51■■■□□ 2.64
LRRIQ1Q96JM4 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.64
LRRIQ1Q96JM4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
LRRIQ1Q96JM4 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
LRRIQ1Q96JM4 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
LRRIQ1Q96JM4 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
LRRIQ1Q96JM4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
LRRIQ1Q96JM4 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
LRRIQ1Q96JM4 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
LRRIQ1Q96JM4 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
LRRIQ1Q96JM4 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
LRRIQ1Q96JM4 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
LRRIQ1Q96JM4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC31.5■■■□□ 2.63
LRRIQ1Q96JM4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
LRRIQ1Q96JM4 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
LRRIQ1Q96JM4 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
LRRIQ1Q96JM4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
LRRIQ1Q96JM4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
LRRIQ1Q96JM4 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
LRRIQ1Q96JM4 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
LRRIQ1Q96JM4 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
LRRIQ1Q96JM4 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC31.49■■■□□ 2.63
LRRIQ1Q96JM4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
LRRIQ1Q96JM4 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
LRRIQ1Q96JM4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
LRRIQ1Q96JM4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC31.49■■■□□ 2.63
LRRIQ1Q96JM4 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
LRRIQ1Q96JM4 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
LRRIQ1Q96JM4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
LRRIQ1Q96JM4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
LRRIQ1Q96JM4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
LRRIQ1Q96JM4 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
LRRIQ1Q96JM4 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
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