Protein–RNA interactions for Protein: Q96I25

RBM17, Splicing factor 45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM17Q96I25 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RBM17Q96I25 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RBM17Q96I25 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RBM17Q96I25 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RBM17Q96I25 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RBM17Q96I25 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RBM17Q96I25 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RBM17Q96I25 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RBM17Q96I25 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RBM17Q96I25 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RBM17Q96I25 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RBM17Q96I25 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RBM17Q96I25 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBM17Q96I25 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBM17Q96I25 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBM17Q96I25 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBM17Q96I25 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBM17Q96I25 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBM17Q96I25 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBM17Q96I25 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBM17Q96I25 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBM17Q96I25 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBM17Q96I25 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBM17Q96I25 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBM17Q96I25 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBM17Q96I25 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBM17Q96I25 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBM17Q96I25 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBM17Q96I25 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBM17Q96I25 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBM17Q96I25 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBM17Q96I25 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBM17Q96I25 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBM17Q96I25 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBM17Q96I25 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBM17Q96I25 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RBM17Q96I25 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBM17Q96I25 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBM17Q96I25 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBM17Q96I25 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBM17Q96I25 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBM17Q96I25 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBM17Q96I25 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBM17Q96I25 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RBM17Q96I25 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RBM17Q96I25 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RBM17Q96I25 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RBM17Q96I25 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RBM17Q96I25 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RBM17Q96I25 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RBM17Q96I25 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RBM17Q96I25 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RBM17Q96I25 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RBM17Q96I25 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RBM17Q96I25 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RBM17Q96I25 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RBM17Q96I25 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RBM17Q96I25 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RBM17Q96I25 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RBM17Q96I25 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RBM17Q96I25 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RBM17Q96I25 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RBM17Q96I25 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RBM17Q96I25 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RBM17Q96I25 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RBM17Q96I25 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RBM17Q96I25 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RBM17Q96I25 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RBM17Q96I25 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RBM17Q96I25 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RBM17Q96I25 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RBM17Q96I25 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RBM17Q96I25 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RBM17Q96I25 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RBM17Q96I25 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RBM17Q96I25 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RBM17Q96I25 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBM17Q96I25 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBM17Q96I25 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBM17Q96I25 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBM17Q96I25 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBM17Q96I25 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBM17Q96I25 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBM17Q96I25 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBM17Q96I25 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBM17Q96I25 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBM17Q96I25 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RBM17Q96I25 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBM17Q96I25 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBM17Q96I25 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBM17Q96I25 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBM17Q96I25 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBM17Q96I25 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RBM17Q96I25 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RBM17Q96I25 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RBM17Q96I25 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RBM17Q96I25 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RBM17Q96I25 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RBM17Q96I25 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RBM17Q96I25 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms