Protein–RNA interactions for Protein: Q96G01

BICD1, Protein bicaudal D homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICD1Q96G01 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BICD1Q96G01 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BICD1Q96G01 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BICD1Q96G01 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BICD1Q96G01 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BICD1Q96G01 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BICD1Q96G01 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BICD1Q96G01 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BICD1Q96G01 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BICD1Q96G01 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BICD1Q96G01 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BICD1Q96G01 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BICD1Q96G01 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BICD1Q96G01 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BICD1Q96G01 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BICD1Q96G01 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
BICD1Q96G01 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
BICD1Q96G01 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BICD1Q96G01 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BICD1Q96G01 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BICD1Q96G01 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BICD1Q96G01 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BICD1Q96G01 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BICD1Q96G01 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BICD1Q96G01 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BICD1Q96G01 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BICD1Q96G01 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BICD1Q96G01 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BICD1Q96G01 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BICD1Q96G01 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
BICD1Q96G01 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BICD1Q96G01 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BICD1Q96G01 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BICD1Q96G01 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BICD1Q96G01 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BICD1Q96G01 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BICD1Q96G01 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BICD1Q96G01 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BICD1Q96G01 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BICD1Q96G01 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BICD1Q96G01 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BICD1Q96G01 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BICD1Q96G01 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BICD1Q96G01 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BICD1Q96G01 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BICD1Q96G01 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
BICD1Q96G01 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BICD1Q96G01 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BICD1Q96G01 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BICD1Q96G01 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BICD1Q96G01 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BICD1Q96G01 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BICD1Q96G01 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BICD1Q96G01 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BICD1Q96G01 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BICD1Q96G01 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BICD1Q96G01 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BICD1Q96G01 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BICD1Q96G01 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BICD1Q96G01 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BICD1Q96G01 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BICD1Q96G01 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BICD1Q96G01 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BICD1Q96G01 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BICD1Q96G01 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BICD1Q96G01 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BICD1Q96G01 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms