Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGF29Q96ES7 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGF29Q96ES7 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGF29Q96ES7 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGF29Q96ES7 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SGF29Q96ES7 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGF29Q96ES7 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGF29Q96ES7 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGF29Q96ES7 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGF29Q96ES7 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGF29Q96ES7 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGF29Q96ES7 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGF29Q96ES7 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGF29Q96ES7 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGF29Q96ES7 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGF29Q96ES7 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGF29Q96ES7 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGF29Q96ES7 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGF29Q96ES7 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGF29Q96ES7 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGF29Q96ES7 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGF29Q96ES7 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGF29Q96ES7 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGF29Q96ES7 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGF29Q96ES7 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGF29Q96ES7 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGF29Q96ES7 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGF29Q96ES7 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGF29Q96ES7 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SGF29Q96ES7 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SGF29Q96ES7 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SGF29Q96ES7 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGF29Q96ES7 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGF29Q96ES7 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGF29Q96ES7 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGF29Q96ES7 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGF29Q96ES7 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGF29Q96ES7 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGF29Q96ES7 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGF29Q96ES7 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGF29Q96ES7 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGF29Q96ES7 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGF29Q96ES7 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGF29Q96ES7 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SGF29Q96ES7 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGF29Q96ES7 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGF29Q96ES7 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGF29Q96ES7 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGF29Q96ES7 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGF29Q96ES7 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGF29Q96ES7 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGF29Q96ES7 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGF29Q96ES7 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGF29Q96ES7 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGF29Q96ES7 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGF29Q96ES7 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGF29Q96ES7 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SGF29Q96ES7 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGF29Q96ES7 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGF29Q96ES7 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGF29Q96ES7 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGF29Q96ES7 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGF29Q96ES7 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGF29Q96ES7 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGF29Q96ES7 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGF29Q96ES7 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGF29Q96ES7 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGF29Q96ES7 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGF29Q96ES7 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGF29Q96ES7 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGF29Q96ES7 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGF29Q96ES7 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGF29Q96ES7 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGF29Q96ES7 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGF29Q96ES7 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SGF29Q96ES7 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGF29Q96ES7 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGF29Q96ES7 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGF29Q96ES7 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGF29Q96ES7 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGF29Q96ES7 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGF29Q96ES7 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGF29Q96ES7 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGF29Q96ES7 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGF29Q96ES7 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGF29Q96ES7 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGF29Q96ES7 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SGF29Q96ES7 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SGF29Q96ES7 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SGF29Q96ES7 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SGF29Q96ES7 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SGF29Q96ES7 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SGF29Q96ES7 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SGF29Q96ES7 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SGF29Q96ES7 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SGF29Q96ES7 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SGF29Q96ES7 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SGF29Q96ES7 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SGF29Q96ES7 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SGF29Q96ES7 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
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