Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MTERF3Q96E29 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms