Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ9

VTI1A, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1AQ96AJ9 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VTI1AQ96AJ9 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms