Protein–RNA interactions for Protein: Q92841

DDX17, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 729 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX17Q92841 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DDX17Q92841 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DDX17Q92841 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
DDX17Q92841 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DDX17Q92841 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DDX17Q92841 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DDX17Q92841 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DDX17Q92841 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DDX17Q92841 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDX17Q92841 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDX17Q92841 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDX17Q92841 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDX17Q92841 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDX17Q92841 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDX17Q92841 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDX17Q92841 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDX17Q92841 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
DDX17Q92841 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDX17Q92841 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDX17Q92841 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDX17Q92841 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDX17Q92841 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDX17Q92841 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDX17Q92841 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DDX17Q92841 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
DDX17Q92841 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
DDX17Q92841 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DDX17Q92841 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DDX17Q92841 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DDX17Q92841 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
DDX17Q92841 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DDX17Q92841 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
DDX17Q92841 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DDX17Q92841 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DDX17Q92841 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
DDX17Q92841 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
DDX17Q92841 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
DDX17Q92841 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
DDX17Q92841 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
DDX17Q92841 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DDX17Q92841 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DDX17Q92841 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
DDX17Q92841 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
DDX17Q92841 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
DDX17Q92841 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
DDX17Q92841 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
DDX17Q92841 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DDX17Q92841 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
DDX17Q92841 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DDX17Q92841 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
DDX17Q92841 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
DDX17Q92841 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DDX17Q92841 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DDX17Q92841 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
DDX17Q92841 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
DDX17Q92841 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DDX17Q92841 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DDX17Q92841 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
DDX17Q92841 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
DDX17Q92841 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DDX17Q92841 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DDX17Q92841 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DDX17Q92841 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DDX17Q92841 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DDX17Q92841 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DDX17Q92841 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
DDX17Q92841 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DDX17Q92841 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DDX17Q92841 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DDX17Q92841 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DDX17Q92841 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DDX17Q92841 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DDX17Q92841 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DDX17Q92841 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DDX17Q92841 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DDX17Q92841 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DDX17Q92841 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DDX17Q92841 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DDX17Q92841 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DDX17Q92841 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DDX17Q92841 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DDX17Q92841 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
DDX17Q92841 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DDX17Q92841 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DDX17Q92841 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DDX17Q92841 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DDX17Q92841 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
DDX17Q92841 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
DDX17Q92841 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DDX17Q92841 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DDX17Q92841 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
DDX17Q92841 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
DDX17Q92841 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DDX17Q92841 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
DDX17Q92841 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
DDX17Q92841 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDX17Q92841 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDX17Q92841 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDX17Q92841 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDX17Q92841 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms