Protein–RNA interactions for Protein: Q92747

ARPC1A, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1A, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1AQ92747 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARPC1AQ92747 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARPC1AQ92747 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARPC1AQ92747 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARPC1AQ92747 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARPC1AQ92747 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARPC1AQ92747 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARPC1AQ92747 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARPC1AQ92747 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARPC1AQ92747 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARPC1AQ92747 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARPC1AQ92747 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
ARPC1AQ92747 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARPC1AQ92747 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARPC1AQ92747 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARPC1AQ92747 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARPC1AQ92747 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARPC1AQ92747 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARPC1AQ92747 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARPC1AQ92747 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARPC1AQ92747 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARPC1AQ92747 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARPC1AQ92747 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARPC1AQ92747 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ARPC1AQ92747 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARPC1AQ92747 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARPC1AQ92747 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARPC1AQ92747 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARPC1AQ92747 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARPC1AQ92747 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARPC1AQ92747 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARPC1AQ92747 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARPC1AQ92747 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARPC1AQ92747 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARPC1AQ92747 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARPC1AQ92747 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARPC1AQ92747 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARPC1AQ92747 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARPC1AQ92747 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARPC1AQ92747 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARPC1AQ92747 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ARPC1AQ92747 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ARPC1AQ92747 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ARPC1AQ92747 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARPC1AQ92747 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARPC1AQ92747 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARPC1AQ92747 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARPC1AQ92747 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARPC1AQ92747 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARPC1AQ92747 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARPC1AQ92747 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARPC1AQ92747 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARPC1AQ92747 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARPC1AQ92747 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARPC1AQ92747 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARPC1AQ92747 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARPC1AQ92747 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARPC1AQ92747 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARPC1AQ92747 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARPC1AQ92747 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARPC1AQ92747 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARPC1AQ92747 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARPC1AQ92747 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARPC1AQ92747 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARPC1AQ92747 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARPC1AQ92747 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARPC1AQ92747 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARPC1AQ92747 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARPC1AQ92747 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARPC1AQ92747 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARPC1AQ92747 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ARPC1AQ92747 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARPC1AQ92747 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARPC1AQ92747 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ARPC1AQ92747 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ARPC1AQ92747 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARPC1AQ92747 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ARPC1AQ92747 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ARPC1AQ92747 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARPC1AQ92747 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARPC1AQ92747 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARPC1AQ92747 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARPC1AQ92747 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ARPC1AQ92747 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARPC1AQ92747 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARPC1AQ92747 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARPC1AQ92747 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARPC1AQ92747 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARPC1AQ92747 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARPC1AQ92747 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARPC1AQ92747 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARPC1AQ92747 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARPC1AQ92747 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARPC1AQ92747 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARPC1AQ92747 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARPC1AQ92747 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARPC1AQ92747 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARPC1AQ92747 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARPC1AQ92747 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARPC1AQ92747 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms