Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUA8

TSKU, Tsukushin, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKUQ8WUA8 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSKUQ8WUA8 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSKUQ8WUA8 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSKUQ8WUA8 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSKUQ8WUA8 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSKUQ8WUA8 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSKUQ8WUA8 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSKUQ8WUA8 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSKUQ8WUA8 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSKUQ8WUA8 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSKUQ8WUA8 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSKUQ8WUA8 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSKUQ8WUA8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSKUQ8WUA8 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSKUQ8WUA8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TSKUQ8WUA8 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSKUQ8WUA8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSKUQ8WUA8 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TSKUQ8WUA8 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSKUQ8WUA8 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSKUQ8WUA8 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSKUQ8WUA8 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSKUQ8WUA8 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSKUQ8WUA8 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSKUQ8WUA8 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TSKUQ8WUA8 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSKUQ8WUA8 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSKUQ8WUA8 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSKUQ8WUA8 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSKUQ8WUA8 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSKUQ8WUA8 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSKUQ8WUA8 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSKUQ8WUA8 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSKUQ8WUA8 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSKUQ8WUA8 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSKUQ8WUA8 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSKUQ8WUA8 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSKUQ8WUA8 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSKUQ8WUA8 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSKUQ8WUA8 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSKUQ8WUA8 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSKUQ8WUA8 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSKUQ8WUA8 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSKUQ8WUA8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSKUQ8WUA8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSKUQ8WUA8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSKUQ8WUA8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSKUQ8WUA8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSKUQ8WUA8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSKUQ8WUA8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TSKUQ8WUA8 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSKUQ8WUA8 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSKUQ8WUA8 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSKUQ8WUA8 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSKUQ8WUA8 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSKUQ8WUA8 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TSKUQ8WUA8 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSKUQ8WUA8 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSKUQ8WUA8 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSKUQ8WUA8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSKUQ8WUA8 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSKUQ8WUA8 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSKUQ8WUA8 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSKUQ8WUA8 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSKUQ8WUA8 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSKUQ8WUA8 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSKUQ8WUA8 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSKUQ8WUA8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSKUQ8WUA8 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSKUQ8WUA8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSKUQ8WUA8 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSKUQ8WUA8 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSKUQ8WUA8 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSKUQ8WUA8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSKUQ8WUA8 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSKUQ8WUA8 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSKUQ8WUA8 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSKUQ8WUA8 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSKUQ8WUA8 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSKUQ8WUA8 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSKUQ8WUA8 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSKUQ8WUA8 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSKUQ8WUA8 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSKUQ8WUA8 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSKUQ8WUA8 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSKUQ8WUA8 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSKUQ8WUA8 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSKUQ8WUA8 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSKUQ8WUA8 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSKUQ8WUA8 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSKUQ8WUA8 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSKUQ8WUA8 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSKUQ8WUA8 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSKUQ8WUA8 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSKUQ8WUA8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSKUQ8WUA8 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSKUQ8WUA8 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSKUQ8WUA8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSKUQ8WUA8 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSKUQ8WUA8 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms