Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE77

SSH3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH3Q8TE77 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SSH3Q8TE77 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SSH3Q8TE77 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SSH3Q8TE77 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SSH3Q8TE77 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SSH3Q8TE77 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SSH3Q8TE77 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SSH3Q8TE77 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SSH3Q8TE77 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SSH3Q8TE77 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SSH3Q8TE77 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SSH3Q8TE77 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SSH3Q8TE77 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SSH3Q8TE77 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SSH3Q8TE77 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SSH3Q8TE77 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SSH3Q8TE77 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SSH3Q8TE77 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SSH3Q8TE77 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SSH3Q8TE77 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SSH3Q8TE77 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SSH3Q8TE77 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SSH3Q8TE77 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SSH3Q8TE77 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SSH3Q8TE77 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SSH3Q8TE77 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SSH3Q8TE77 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SSH3Q8TE77 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SSH3Q8TE77 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SSH3Q8TE77 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SSH3Q8TE77 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SSH3Q8TE77 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SSH3Q8TE77 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SSH3Q8TE77 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SSH3Q8TE77 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SSH3Q8TE77 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SSH3Q8TE77 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SSH3Q8TE77 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SSH3Q8TE77 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SSH3Q8TE77 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SSH3Q8TE77 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SSH3Q8TE77 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SSH3Q8TE77 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SSH3Q8TE77 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SSH3Q8TE77 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SSH3Q8TE77 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SSH3Q8TE77 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SSH3Q8TE77 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SSH3Q8TE77 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SSH3Q8TE77 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SSH3Q8TE77 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SSH3Q8TE77 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SSH3Q8TE77 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SSH3Q8TE77 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SSH3Q8TE77 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SSH3Q8TE77 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SSH3Q8TE77 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SSH3Q8TE77 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SSH3Q8TE77 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SSH3Q8TE77 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SSH3Q8TE77 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SSH3Q8TE77 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SSH3Q8TE77 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SSH3Q8TE77 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SSH3Q8TE77 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SSH3Q8TE77 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SSH3Q8TE77 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SSH3Q8TE77 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SSH3Q8TE77 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SSH3Q8TE77 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SSH3Q8TE77 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SSH3Q8TE77 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SSH3Q8TE77 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SSH3Q8TE77 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SSH3Q8TE77 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SSH3Q8TE77 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SSH3Q8TE77 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SSH3Q8TE77 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SSH3Q8TE77 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SSH3Q8TE77 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SSH3Q8TE77 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SSH3Q8TE77 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SSH3Q8TE77 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SSH3Q8TE77 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SSH3Q8TE77 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SSH3Q8TE77 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SSH3Q8TE77 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SSH3Q8TE77 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SSH3Q8TE77 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SSH3Q8TE77 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SSH3Q8TE77 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SSH3Q8TE77 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SSH3Q8TE77 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SSH3Q8TE77 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SSH3Q8TE77 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SSH3Q8TE77 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SSH3Q8TE77 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SSH3Q8TE77 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SSH3Q8TE77 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SSH3Q8TE77 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms