Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDW7

FAT3, Protocadherin Fat 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,589 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAT3Q8TDW7 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC12□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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FAT3Q8TDW7 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
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