Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG4

HELQ, Helicase POLQ-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELQQ8TDG4 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HELQQ8TDG4 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HELQQ8TDG4 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HELQQ8TDG4 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HELQQ8TDG4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HELQQ8TDG4 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HELQQ8TDG4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HELQQ8TDG4 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HELQQ8TDG4 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HELQQ8TDG4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HELQQ8TDG4 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HELQQ8TDG4 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HELQQ8TDG4 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HELQQ8TDG4 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HELQQ8TDG4 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HELQQ8TDG4 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HELQQ8TDG4 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HELQQ8TDG4 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HELQQ8TDG4 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HELQQ8TDG4 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HELQQ8TDG4 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HELQQ8TDG4 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HELQQ8TDG4 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HELQQ8TDG4 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HELQQ8TDG4 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HELQQ8TDG4 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HELQQ8TDG4 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HELQQ8TDG4 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HELQQ8TDG4 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HELQQ8TDG4 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HELQQ8TDG4 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HELQQ8TDG4 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HELQQ8TDG4 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HELQQ8TDG4 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HELQQ8TDG4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HELQQ8TDG4 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HELQQ8TDG4 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HELQQ8TDG4 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HELQQ8TDG4 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HELQQ8TDG4 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HELQQ8TDG4 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HELQQ8TDG4 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HELQQ8TDG4 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HELQQ8TDG4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HELQQ8TDG4 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HELQQ8TDG4 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HELQQ8TDG4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HELQQ8TDG4 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HELQQ8TDG4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HELQQ8TDG4 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HELQQ8TDG4 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HELQQ8TDG4 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HELQQ8TDG4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HELQQ8TDG4 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HELQQ8TDG4 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HELQQ8TDG4 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HELQQ8TDG4 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HELQQ8TDG4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HELQQ8TDG4 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HELQQ8TDG4 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HELQQ8TDG4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HELQQ8TDG4 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HELQQ8TDG4 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HELQQ8TDG4 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HELQQ8TDG4 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HELQQ8TDG4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HELQQ8TDG4 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HELQQ8TDG4 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HELQQ8TDG4 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HELQQ8TDG4 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HELQQ8TDG4 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HELQQ8TDG4 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HELQQ8TDG4 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HELQQ8TDG4 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HELQQ8TDG4 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HELQQ8TDG4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HELQQ8TDG4 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HELQQ8TDG4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HELQQ8TDG4 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HELQQ8TDG4 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HELQQ8TDG4 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HELQQ8TDG4 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HELQQ8TDG4 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HELQQ8TDG4 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HELQQ8TDG4 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HELQQ8TDG4 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HELQQ8TDG4 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HELQQ8TDG4 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HELQQ8TDG4 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HELQQ8TDG4 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HELQQ8TDG4 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HELQQ8TDG4 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HELQQ8TDG4 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HELQQ8TDG4 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HELQQ8TDG4 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HELQQ8TDG4 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HELQQ8TDG4 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HELQQ8TDG4 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HELQQ8TDG4 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HELQQ8TDG4 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms