Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND04

SMG8, Protein SMG8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG8Q8ND04 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMG8Q8ND04 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMG8Q8ND04 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMG8Q8ND04 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SMG8Q8ND04 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMG8Q8ND04 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMG8Q8ND04 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMG8Q8ND04 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMG8Q8ND04 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMG8Q8ND04 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMG8Q8ND04 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SMG8Q8ND04 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SMG8Q8ND04 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SMG8Q8ND04 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SMG8Q8ND04 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SMG8Q8ND04 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMG8Q8ND04 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMG8Q8ND04 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMG8Q8ND04 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMG8Q8ND04 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMG8Q8ND04 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMG8Q8ND04 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SMG8Q8ND04 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMG8Q8ND04 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMG8Q8ND04 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMG8Q8ND04 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMG8Q8ND04 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMG8Q8ND04 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMG8Q8ND04 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMG8Q8ND04 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMG8Q8ND04 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMG8Q8ND04 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMG8Q8ND04 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMG8Q8ND04 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMG8Q8ND04 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMG8Q8ND04 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMG8Q8ND04 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMG8Q8ND04 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMG8Q8ND04 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMG8Q8ND04 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMG8Q8ND04 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMG8Q8ND04 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SMG8Q8ND04 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMG8Q8ND04 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMG8Q8ND04 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMG8Q8ND04 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMG8Q8ND04 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SMG8Q8ND04 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMG8Q8ND04 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMG8Q8ND04 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMG8Q8ND04 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMG8Q8ND04 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SMG8Q8ND04 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMG8Q8ND04 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMG8Q8ND04 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMG8Q8ND04 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMG8Q8ND04 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMG8Q8ND04 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMG8Q8ND04 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMG8Q8ND04 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMG8Q8ND04 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMG8Q8ND04 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMG8Q8ND04 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMG8Q8ND04 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMG8Q8ND04 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMG8Q8ND04 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMG8Q8ND04 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMG8Q8ND04 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMG8Q8ND04 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMG8Q8ND04 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SMG8Q8ND04 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMG8Q8ND04 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMG8Q8ND04 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMG8Q8ND04 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMG8Q8ND04 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMG8Q8ND04 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMG8Q8ND04 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMG8Q8ND04 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMG8Q8ND04 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMG8Q8ND04 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMG8Q8ND04 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SMG8Q8ND04 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMG8Q8ND04 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMG8Q8ND04 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMG8Q8ND04 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMG8Q8ND04 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMG8Q8ND04 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMG8Q8ND04 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMG8Q8ND04 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMG8Q8ND04 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMG8Q8ND04 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMG8Q8ND04 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SMG8Q8ND04 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMG8Q8ND04 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMG8Q8ND04 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMG8Q8ND04 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMG8Q8ND04 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMG8Q8ND04 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMG8Q8ND04 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SMG8Q8ND04 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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