Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ANKRD53Q8N9V6 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ANKRD53Q8N9V6 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ANKRD53Q8N9V6 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ANKRD53Q8N9V6 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ANKRD53Q8N9V6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ANKRD53Q8N9V6 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ANKRD53Q8N9V6 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ANKRD53Q8N9V6 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ANKRD53Q8N9V6 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ANKRD53Q8N9V6 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ANKRD53Q8N9V6 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ANKRD53Q8N9V6 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ANKRD53Q8N9V6 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ANKRD53Q8N9V6 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ANKRD53Q8N9V6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ANKRD53Q8N9V6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ANKRD53Q8N9V6 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ANKRD53Q8N9V6 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ANKRD53Q8N9V6 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ANKRD53Q8N9V6 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ANKRD53Q8N9V6 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ANKRD53Q8N9V6 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ANKRD53Q8N9V6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ANKRD53Q8N9V6 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ANKRD53Q8N9V6 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ANKRD53Q8N9V6 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ANKRD53Q8N9V6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ANKRD53Q8N9V6 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ANKRD53Q8N9V6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ANKRD53Q8N9V6 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ANKRD53Q8N9V6 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ANKRD53Q8N9V6 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ANKRD53Q8N9V6 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ANKRD53Q8N9V6 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ANKRD53Q8N9V6 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ANKRD53Q8N9V6 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ANKRD53Q8N9V6 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ANKRD53Q8N9V6 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ANKRD53Q8N9V6 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ANKRD53Q8N9V6 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ANKRD53Q8N9V6 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ANKRD53Q8N9V6 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ANKRD53Q8N9V6 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ANKRD53Q8N9V6 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ANKRD53Q8N9V6 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ANKRD53Q8N9V6 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ANKRD53Q8N9V6 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ANKRD53Q8N9V6 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ANKRD53Q8N9V6 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ANKRD53Q8N9V6 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ANKRD53Q8N9V6 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ANKRD53Q8N9V6 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ANKRD53Q8N9V6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ANKRD53Q8N9V6 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ANKRD53Q8N9V6 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ANKRD53Q8N9V6 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ANKRD53Q8N9V6 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms