Protein–RNA interactions for Protein: Q8N511

TMEM199, Transmembrane protein 199, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM199Q8N511 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM199Q8N511 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM199Q8N511 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM199Q8N511 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM199Q8N511 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM199Q8N511 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM199Q8N511 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM199Q8N511 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM199Q8N511 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM199Q8N511 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM199Q8N511 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM199Q8N511 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM199Q8N511 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM199Q8N511 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM199Q8N511 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM199Q8N511 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM199Q8N511 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM199Q8N511 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM199Q8N511 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM199Q8N511 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM199Q8N511 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM199Q8N511 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM199Q8N511 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM199Q8N511 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM199Q8N511 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM199Q8N511 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM199Q8N511 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM199Q8N511 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM199Q8N511 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM199Q8N511 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM199Q8N511 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM199Q8N511 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM199Q8N511 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM199Q8N511 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM199Q8N511 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM199Q8N511 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM199Q8N511 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM199Q8N511 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM199Q8N511 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM199Q8N511 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM199Q8N511 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM199Q8N511 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM199Q8N511 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM199Q8N511 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM199Q8N511 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM199Q8N511 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM199Q8N511 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM199Q8N511 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM199Q8N511 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM199Q8N511 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM199Q8N511 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM199Q8N511 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM199Q8N511 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM199Q8N511 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM199Q8N511 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM199Q8N511 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM199Q8N511 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM199Q8N511 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM199Q8N511 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM199Q8N511 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM199Q8N511 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM199Q8N511 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM199Q8N511 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM199Q8N511 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM199Q8N511 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM199Q8N511 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM199Q8N511 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM199Q8N511 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM199Q8N511 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM199Q8N511 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM199Q8N511 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM199Q8N511 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM199Q8N511 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM199Q8N511 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM199Q8N511 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM199Q8N511 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM199Q8N511 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM199Q8N511 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM199Q8N511 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM199Q8N511 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM199Q8N511 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM199Q8N511 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM199Q8N511 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM199Q8N511 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM199Q8N511 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM199Q8N511 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM199Q8N511 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM199Q8N511 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM199Q8N511 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM199Q8N511 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM199Q8N511 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM199Q8N511 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM199Q8N511 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM199Q8N511 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM199Q8N511 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM199Q8N511 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM199Q8N511 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM199Q8N511 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM199Q8N511 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM199Q8N511 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms