Protein–RNA interactions for Protein: Q8N427

NME8, Thioredoxin domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME8Q8N427 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NME8Q8N427 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.27■■□□□ 1.15
NME8Q8N427 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
NME8Q8N427 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NME8Q8N427 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NME8Q8N427 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NME8Q8N427 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NME8Q8N427 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NME8Q8N427 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NME8Q8N427 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
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