Protein–RNA interactions for Protein: Q8N283

ANKRD35, Ankyrin repeat domain-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD35Q8N283 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ANKRD35Q8N283 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ANKRD35Q8N283 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ANKRD35Q8N283 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ANKRD35Q8N283 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ANKRD35Q8N283 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ANKRD35Q8N283 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ANKRD35Q8N283 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ANKRD35Q8N283 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ANKRD35Q8N283 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ANKRD35Q8N283 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ANKRD35Q8N283 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ANKRD35Q8N283 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ANKRD35Q8N283 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ANKRD35Q8N283 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ANKRD35Q8N283 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ANKRD35Q8N283 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ANKRD35Q8N283 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ANKRD35Q8N283 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ANKRD35Q8N283 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ANKRD35Q8N283 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ANKRD35Q8N283 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ANKRD35Q8N283 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ANKRD35Q8N283 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ANKRD35Q8N283 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ANKRD35Q8N283 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ANKRD35Q8N283 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ANKRD35Q8N283 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ANKRD35Q8N283 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ANKRD35Q8N283 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ANKRD35Q8N283 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ANKRD35Q8N283 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ANKRD35Q8N283 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ANKRD35Q8N283 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ANKRD35Q8N283 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ANKRD35Q8N283 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ANKRD35Q8N283 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ANKRD35Q8N283 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ANKRD35Q8N283 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ANKRD35Q8N283 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ANKRD35Q8N283 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ANKRD35Q8N283 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ANKRD35Q8N283 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ANKRD35Q8N283 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ANKRD35Q8N283 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ANKRD35Q8N283 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ANKRD35Q8N283 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ANKRD35Q8N283 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ANKRD35Q8N283 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ANKRD35Q8N283 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ANKRD35Q8N283 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ANKRD35Q8N283 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ANKRD35Q8N283 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ANKRD35Q8N283 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ANKRD35Q8N283 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ANKRD35Q8N283 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ANKRD35Q8N283 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ANKRD35Q8N283 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ANKRD35Q8N283 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ANKRD35Q8N283 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ANKRD35Q8N283 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ANKRD35Q8N283 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ANKRD35Q8N283 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ANKRD35Q8N283 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ANKRD35Q8N283 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ANKRD35Q8N283 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ANKRD35Q8N283 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ANKRD35Q8N283 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ANKRD35Q8N283 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ANKRD35Q8N283 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ANKRD35Q8N283 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ANKRD35Q8N283 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ANKRD35Q8N283 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ANKRD35Q8N283 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ANKRD35Q8N283 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ANKRD35Q8N283 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ANKRD35Q8N283 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ANKRD35Q8N283 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ANKRD35Q8N283 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ANKRD35Q8N283 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ANKRD35Q8N283 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ANKRD35Q8N283 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ANKRD35Q8N283 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ANKRD35Q8N283 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ANKRD35Q8N283 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ANKRD35Q8N283 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ANKRD35Q8N283 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ANKRD35Q8N283 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ANKRD35Q8N283 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ANKRD35Q8N283 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ANKRD35Q8N283 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ANKRD35Q8N283 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ANKRD35Q8N283 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ANKRD35Q8N283 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ANKRD35Q8N283 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ANKRD35Q8N283 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ANKRD35Q8N283 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ANKRD35Q8N283 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ANKRD35Q8N283 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ANKRD35Q8N283 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms