Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNX29P2Q8IUI4 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX29P2Q8IUI4 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX29P2Q8IUI4 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX29P2Q8IUI4 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX29P2Q8IUI4 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX29P2Q8IUI4 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX29P2Q8IUI4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX29P2Q8IUI4 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX29P2Q8IUI4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX29P2Q8IUI4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX29P2Q8IUI4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX29P2Q8IUI4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX29P2Q8IUI4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX29P2Q8IUI4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX29P2Q8IUI4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX29P2Q8IUI4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX29P2Q8IUI4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX29P2Q8IUI4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX29P2Q8IUI4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX29P2Q8IUI4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX29P2Q8IUI4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX29P2Q8IUI4 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX29P2Q8IUI4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX29P2Q8IUI4 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX29P2Q8IUI4 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX29P2Q8IUI4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX29P2Q8IUI4 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX29P2Q8IUI4 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX29P2Q8IUI4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX29P2Q8IUI4 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX29P2Q8IUI4 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX29P2Q8IUI4 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNX29P2Q8IUI4 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNX29P2Q8IUI4 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNX29P2Q8IUI4 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNX29P2Q8IUI4 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNX29P2Q8IUI4 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNX29P2Q8IUI4 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNX29P2Q8IUI4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNX29P2Q8IUI4 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNX29P2Q8IUI4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNX29P2Q8IUI4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNX29P2Q8IUI4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SNX29P2Q8IUI4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SNX29P2Q8IUI4 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNX29P2Q8IUI4 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNX29P2Q8IUI4 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNX29P2Q8IUI4 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SNX29P2Q8IUI4 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SNX29P2Q8IUI4 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNX29P2Q8IUI4 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNX29P2Q8IUI4 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNX29P2Q8IUI4 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNX29P2Q8IUI4 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNX29P2Q8IUI4 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNX29P2Q8IUI4 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNX29P2Q8IUI4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNX29P2Q8IUI4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNX29P2Q8IUI4 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX29P2Q8IUI4 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX29P2Q8IUI4 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX29P2Q8IUI4 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX29P2Q8IUI4 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX29P2Q8IUI4 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX29P2Q8IUI4 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX29P2Q8IUI4 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX29P2Q8IUI4 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX29P2Q8IUI4 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX29P2Q8IUI4 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX29P2Q8IUI4 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX29P2Q8IUI4 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX29P2Q8IUI4 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX29P2Q8IUI4 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX29P2Q8IUI4 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX29P2Q8IUI4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX29P2Q8IUI4 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX29P2Q8IUI4 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX29P2Q8IUI4 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX29P2Q8IUI4 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX29P2Q8IUI4 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX29P2Q8IUI4 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX29P2Q8IUI4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX29P2Q8IUI4 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX29P2Q8IUI4 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX29P2Q8IUI4 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX29P2Q8IUI4 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX29P2Q8IUI4 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX29P2Q8IUI4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX29P2Q8IUI4 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX29P2Q8IUI4 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX29P2Q8IUI4 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX29P2Q8IUI4 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX29P2Q8IUI4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX29P2Q8IUI4 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX29P2Q8IUI4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX29P2Q8IUI4 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX29P2Q8IUI4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX29P2Q8IUI4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX29P2Q8IUI4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms