Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6B7

SRGAP1, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP1Q7Z6B7 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRGAP1Q7Z6B7 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRGAP1Q7Z6B7 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRGAP1Q7Z6B7 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRGAP1Q7Z6B7 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRGAP1Q7Z6B7 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRGAP1Q7Z6B7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRGAP1Q7Z6B7 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRGAP1Q7Z6B7 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRGAP1Q7Z6B7 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRGAP1Q7Z6B7 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SRGAP1Q7Z6B7 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRGAP1Q7Z6B7 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRGAP1Q7Z6B7 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRGAP1Q7Z6B7 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRGAP1Q7Z6B7 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRGAP1Q7Z6B7 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRGAP1Q7Z6B7 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRGAP1Q7Z6B7 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRGAP1Q7Z6B7 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SRGAP1Q7Z6B7 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRGAP1Q7Z6B7 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRGAP1Q7Z6B7 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRGAP1Q7Z6B7 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRGAP1Q7Z6B7 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRGAP1Q7Z6B7 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRGAP1Q7Z6B7 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRGAP1Q7Z6B7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRGAP1Q7Z6B7 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRGAP1Q7Z6B7 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRGAP1Q7Z6B7 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRGAP1Q7Z6B7 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRGAP1Q7Z6B7 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRGAP1Q7Z6B7 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRGAP1Q7Z6B7 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRGAP1Q7Z6B7 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRGAP1Q7Z6B7 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRGAP1Q7Z6B7 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SRGAP1Q7Z6B7 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRGAP1Q7Z6B7 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRGAP1Q7Z6B7 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRGAP1Q7Z6B7 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRGAP1Q7Z6B7 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRGAP1Q7Z6B7 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRGAP1Q7Z6B7 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRGAP1Q7Z6B7 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRGAP1Q7Z6B7 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRGAP1Q7Z6B7 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRGAP1Q7Z6B7 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRGAP1Q7Z6B7 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRGAP1Q7Z6B7 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRGAP1Q7Z6B7 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRGAP1Q7Z6B7 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRGAP1Q7Z6B7 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRGAP1Q7Z6B7 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRGAP1Q7Z6B7 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRGAP1Q7Z6B7 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRGAP1Q7Z6B7 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRGAP1Q7Z6B7 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRGAP1Q7Z6B7 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRGAP1Q7Z6B7 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRGAP1Q7Z6B7 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRGAP1Q7Z6B7 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRGAP1Q7Z6B7 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRGAP1Q7Z6B7 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRGAP1Q7Z6B7 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRGAP1Q7Z6B7 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRGAP1Q7Z6B7 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRGAP1Q7Z6B7 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRGAP1Q7Z6B7 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRGAP1Q7Z6B7 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRGAP1Q7Z6B7 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRGAP1Q7Z6B7 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRGAP1Q7Z6B7 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRGAP1Q7Z6B7 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRGAP1Q7Z6B7 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRGAP1Q7Z6B7 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRGAP1Q7Z6B7 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRGAP1Q7Z6B7 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRGAP1Q7Z6B7 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRGAP1Q7Z6B7 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRGAP1Q7Z6B7 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRGAP1Q7Z6B7 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRGAP1Q7Z6B7 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRGAP1Q7Z6B7 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRGAP1Q7Z6B7 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRGAP1Q7Z6B7 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRGAP1Q7Z6B7 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRGAP1Q7Z6B7 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRGAP1Q7Z6B7 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRGAP1Q7Z6B7 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRGAP1Q7Z6B7 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRGAP1Q7Z6B7 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRGAP1Q7Z6B7 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SRGAP1Q7Z6B7 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRGAP1Q7Z6B7 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SRGAP1Q7Z6B7 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SRGAP1Q7Z6B7 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SRGAP1Q7Z6B7 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SRGAP1Q7Z6B7 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms