Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
KRT28Q7Z3Y7 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KRT28Q7Z3Y7 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KRT28Q7Z3Y7 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
KRT28Q7Z3Y7 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
KRT28Q7Z3Y7 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
KRT28Q7Z3Y7 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KRT28Q7Z3Y7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
KRT28Q7Z3Y7 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
KRT28Q7Z3Y7 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
KRT28Q7Z3Y7 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
KRT28Q7Z3Y7 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KRT28Q7Z3Y7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KRT28Q7Z3Y7 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
KRT28Q7Z3Y7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KRT28Q7Z3Y7 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KRT28Q7Z3Y7 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
KRT28Q7Z3Y7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KRT28Q7Z3Y7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KRT28Q7Z3Y7 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KRT28Q7Z3Y7 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KRT28Q7Z3Y7 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
KRT28Q7Z3Y7 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC27.55■■■□□ 2
KRT28Q7Z3Y7 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KRT28Q7Z3Y7 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
KRT28Q7Z3Y7 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
KRT28Q7Z3Y7 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
KRT28Q7Z3Y7 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
KRT28Q7Z3Y7 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
KRT28Q7Z3Y7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KRT28Q7Z3Y7 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KRT28Q7Z3Y7 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
KRT28Q7Z3Y7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KRT28Q7Z3Y7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KRT28Q7Z3Y7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KRT28Q7Z3Y7 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KRT28Q7Z3Y7 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
KRT28Q7Z3Y7 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KRT28Q7Z3Y7 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KRT28Q7Z3Y7 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KRT28Q7Z3Y7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KRT28Q7Z3Y7 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KRT28Q7Z3Y7 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
KRT28Q7Z3Y7 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
KRT28Q7Z3Y7 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
KRT28Q7Z3Y7 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
KRT28Q7Z3Y7 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
KRT28Q7Z3Y7 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KRT28Q7Z3Y7 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
KRT28Q7Z3Y7 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
KRT28Q7Z3Y7 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
KRT28Q7Z3Y7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KRT28Q7Z3Y7 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
KRT28Q7Z3Y7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC27.53■■■□□ 2
KRT28Q7Z3Y7 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
KRT28Q7Z3Y7 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC27.53■■■□□ 2
KRT28Q7Z3Y7 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KRT28Q7Z3Y7 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KRT28Q7Z3Y7 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC27.53■■■□□ 2
KRT28Q7Z3Y7 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KRT28Q7Z3Y7 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KRT28Q7Z3Y7 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC27.53■■■□□ 2
KRT28Q7Z3Y7 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KRT28Q7Z3Y7 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KRT28Q7Z3Y7 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
KRT28Q7Z3Y7 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
KRT28Q7Z3Y7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KRT28Q7Z3Y7 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
KRT28Q7Z3Y7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
KRT28Q7Z3Y7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
KRT28Q7Z3Y7 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KRT28Q7Z3Y7 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KRT28Q7Z3Y7 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
KRT28Q7Z3Y7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KRT28Q7Z3Y7 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
KRT28Q7Z3Y7 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KRT28Q7Z3Y7 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
KRT28Q7Z3Y7 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC27.52■■■□□ 2
KRT28Q7Z3Y7 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
KRT28Q7Z3Y7 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
KRT28Q7Z3Y7 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
KRT28Q7Z3Y7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KRT28Q7Z3Y7 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
KRT28Q7Z3Y7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KRT28Q7Z3Y7 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KRT28Q7Z3Y7 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KRT28Q7Z3Y7 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
KRT28Q7Z3Y7 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
KRT28Q7Z3Y7 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC27.51■■■□□ 2
KRT28Q7Z3Y7 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KRT28Q7Z3Y7 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KRT28Q7Z3Y7 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KRT28Q7Z3Y7 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KRT28Q7Z3Y7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KRT28Q7Z3Y7 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
KRT28Q7Z3Y7 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
KRT28Q7Z3Y7 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KRT28Q7Z3Y7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KRT28Q7Z3Y7 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KRT28Q7Z3Y7 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms