Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW61

BBS12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS12Q6ZW61 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BBS12Q6ZW61 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms