Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVM7

TOM1L2, TOM1-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1L2Q6ZVM7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TOM1L2Q6ZVM7 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TOM1L2Q6ZVM7 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TOM1L2Q6ZVM7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TOM1L2Q6ZVM7 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TOM1L2Q6ZVM7 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TOM1L2Q6ZVM7 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TOM1L2Q6ZVM7 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TOM1L2Q6ZVM7 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TOM1L2Q6ZVM7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TOM1L2Q6ZVM7 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TOM1L2Q6ZVM7 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TOM1L2Q6ZVM7 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TOM1L2Q6ZVM7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TOM1L2Q6ZVM7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TOM1L2Q6ZVM7 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TOM1L2Q6ZVM7 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TOM1L2Q6ZVM7 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TOM1L2Q6ZVM7 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TOM1L2Q6ZVM7 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TOM1L2Q6ZVM7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TOM1L2Q6ZVM7 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TOM1L2Q6ZVM7 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TOM1L2Q6ZVM7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TOM1L2Q6ZVM7 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TOM1L2Q6ZVM7 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TOM1L2Q6ZVM7 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TOM1L2Q6ZVM7 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TOM1L2Q6ZVM7 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TOM1L2Q6ZVM7 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TOM1L2Q6ZVM7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TOM1L2Q6ZVM7 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TOM1L2Q6ZVM7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TOM1L2Q6ZVM7 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TOM1L2Q6ZVM7 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TOM1L2Q6ZVM7 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TOM1L2Q6ZVM7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TOM1L2Q6ZVM7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TOM1L2Q6ZVM7 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TOM1L2Q6ZVM7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TOM1L2Q6ZVM7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TOM1L2Q6ZVM7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TOM1L2Q6ZVM7 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TOM1L2Q6ZVM7 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TOM1L2Q6ZVM7 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TOM1L2Q6ZVM7 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TOM1L2Q6ZVM7 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TOM1L2Q6ZVM7 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TOM1L2Q6ZVM7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TOM1L2Q6ZVM7 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TOM1L2Q6ZVM7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TOM1L2Q6ZVM7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TOM1L2Q6ZVM7 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TOM1L2Q6ZVM7 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TOM1L2Q6ZVM7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TOM1L2Q6ZVM7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TOM1L2Q6ZVM7 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TOM1L2Q6ZVM7 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TOM1L2Q6ZVM7 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TOM1L2Q6ZVM7 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TOM1L2Q6ZVM7 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TOM1L2Q6ZVM7 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TOM1L2Q6ZVM7 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TOM1L2Q6ZVM7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TOM1L2Q6ZVM7 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TOM1L2Q6ZVM7 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TOM1L2Q6ZVM7 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TOM1L2Q6ZVM7 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TOM1L2Q6ZVM7 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TOM1L2Q6ZVM7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TOM1L2Q6ZVM7 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TOM1L2Q6ZVM7 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TOM1L2Q6ZVM7 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TOM1L2Q6ZVM7 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TOM1L2Q6ZVM7 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TOM1L2Q6ZVM7 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TOM1L2Q6ZVM7 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TOM1L2Q6ZVM7 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TOM1L2Q6ZVM7 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TOM1L2Q6ZVM7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TOM1L2Q6ZVM7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TOM1L2Q6ZVM7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TOM1L2Q6ZVM7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TOM1L2Q6ZVM7 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TOM1L2Q6ZVM7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TOM1L2Q6ZVM7 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TOM1L2Q6ZVM7 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TOM1L2Q6ZVM7 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TOM1L2Q6ZVM7 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TOM1L2Q6ZVM7 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TOM1L2Q6ZVM7 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TOM1L2Q6ZVM7 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TOM1L2Q6ZVM7 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TOM1L2Q6ZVM7 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TOM1L2Q6ZVM7 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TOM1L2Q6ZVM7 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TOM1L2Q6ZVM7 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TOM1L2Q6ZVM7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TOM1L2Q6ZVM7 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
TOM1L2Q6ZVM7 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms