Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBR3Q6ZT12 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
UBR3Q6ZT12 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBR3Q6ZT12 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBR3Q6ZT12 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBR3Q6ZT12 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBR3Q6ZT12 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBR3Q6ZT12 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBR3Q6ZT12 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBR3Q6ZT12 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
UBR3Q6ZT12 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBR3Q6ZT12 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBR3Q6ZT12 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBR3Q6ZT12 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBR3Q6ZT12 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBR3Q6ZT12 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBR3Q6ZT12 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBR3Q6ZT12 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBR3Q6ZT12 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBR3Q6ZT12 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBR3Q6ZT12 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBR3Q6ZT12 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBR3Q6ZT12 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBR3Q6ZT12 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBR3Q6ZT12 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBR3Q6ZT12 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBR3Q6ZT12 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBR3Q6ZT12 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBR3Q6ZT12 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBR3Q6ZT12 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBR3Q6ZT12 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBR3Q6ZT12 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBR3Q6ZT12 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBR3Q6ZT12 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBR3Q6ZT12 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBR3Q6ZT12 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBR3Q6ZT12 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBR3Q6ZT12 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBR3Q6ZT12 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBR3Q6ZT12 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBR3Q6ZT12 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBR3Q6ZT12 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBR3Q6ZT12 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBR3Q6ZT12 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBR3Q6ZT12 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBR3Q6ZT12 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBR3Q6ZT12 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBR3Q6ZT12 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBR3Q6ZT12 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBR3Q6ZT12 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBR3Q6ZT12 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
UBR3Q6ZT12 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBR3Q6ZT12 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
UBR3Q6ZT12 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBR3Q6ZT12 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBR3Q6ZT12 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
UBR3Q6ZT12 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
UBR3Q6ZT12 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
UBR3Q6ZT12 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
UBR3Q6ZT12 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
UBR3Q6ZT12 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBR3Q6ZT12 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBR3Q6ZT12 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBR3Q6ZT12 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBR3Q6ZT12 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBR3Q6ZT12 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBR3Q6ZT12 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBR3Q6ZT12 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBR3Q6ZT12 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBR3Q6ZT12 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBR3Q6ZT12 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBR3Q6ZT12 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBR3Q6ZT12 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBR3Q6ZT12 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBR3Q6ZT12 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBR3Q6ZT12 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
UBR3Q6ZT12 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBR3Q6ZT12 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBR3Q6ZT12 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBR3Q6ZT12 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBR3Q6ZT12 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBR3Q6ZT12 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBR3Q6ZT12 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBR3Q6ZT12 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBR3Q6ZT12 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBR3Q6ZT12 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBR3Q6ZT12 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBR3Q6ZT12 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBR3Q6ZT12 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBR3Q6ZT12 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBR3Q6ZT12 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBR3Q6ZT12 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBR3Q6ZT12 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBR3Q6ZT12 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBR3Q6ZT12 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBR3Q6ZT12 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBR3Q6ZT12 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBR3Q6ZT12 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBR3Q6ZT12 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBR3Q6ZT12 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms