Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CASC2Q6XLA1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms