Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXD4L3Q6VB84 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXD4L3Q6VB84 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXD4L3Q6VB84 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXD4L3Q6VB84 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXD4L3Q6VB84 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXD4L3Q6VB84 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXD4L3Q6VB84 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXD4L3Q6VB84 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXD4L3Q6VB84 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXD4L3Q6VB84 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXD4L3Q6VB84 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXD4L3Q6VB84 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXD4L3Q6VB84 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXD4L3Q6VB84 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXD4L3Q6VB84 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXD4L3Q6VB84 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXD4L3Q6VB84 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXD4L3Q6VB84 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXD4L3Q6VB84 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXD4L3Q6VB84 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXD4L3Q6VB84 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXD4L3Q6VB84 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXD4L3Q6VB84 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXD4L3Q6VB84 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXD4L3Q6VB84 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXD4L3Q6VB84 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXD4L3Q6VB84 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXD4L3Q6VB84 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXD4L3Q6VB84 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXD4L3Q6VB84 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXD4L3Q6VB84 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXD4L3Q6VB84 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXD4L3Q6VB84 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXD4L3Q6VB84 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXD4L3Q6VB84 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXD4L3Q6VB84 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXD4L3Q6VB84 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXD4L3Q6VB84 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXD4L3Q6VB84 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXD4L3Q6VB84 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXD4L3Q6VB84 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXD4L3Q6VB84 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXD4L3Q6VB84 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXD4L3Q6VB84 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXD4L3Q6VB84 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXD4L3Q6VB84 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXD4L3Q6VB84 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXD4L3Q6VB84 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOXD4L3Q6VB84 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOXD4L3Q6VB84 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOXD4L3Q6VB84 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOXD4L3Q6VB84 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOXD4L3Q6VB84 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOXD4L3Q6VB84 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOXD4L3Q6VB84 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOXD4L3Q6VB84 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOXD4L3Q6VB84 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOXD4L3Q6VB84 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOXD4L3Q6VB84 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOXD4L3Q6VB84 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOXD4L3Q6VB84 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOXD4L3Q6VB84 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOXD4L3Q6VB84 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOXD4L3Q6VB84 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOXD4L3Q6VB84 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOXD4L3Q6VB84 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOXD4L3Q6VB84 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOXD4L3Q6VB84 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOXD4L3Q6VB84 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOXD4L3Q6VB84 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOXD4L3Q6VB84 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOXD4L3Q6VB84 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOXD4L3Q6VB84 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOXD4L3Q6VB84 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOXD4L3Q6VB84 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOXD4L3Q6VB84 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOXD4L3Q6VB84 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOXD4L3Q6VB84 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOXD4L3Q6VB84 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms