Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRIG3Q6UXM1 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms