Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEW1

ZCCHC12, Zinc finger CCHC domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC12Q6PEW1 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZCCHC12Q6PEW1 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZCCHC12Q6PEW1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZCCHC12Q6PEW1 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ZCCHC12Q6PEW1 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZCCHC12Q6PEW1 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZCCHC12Q6PEW1 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZCCHC12Q6PEW1 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZCCHC12Q6PEW1 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZCCHC12Q6PEW1 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZCCHC12Q6PEW1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZCCHC12Q6PEW1 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZCCHC12Q6PEW1 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ZCCHC12Q6PEW1 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZCCHC12Q6PEW1 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZCCHC12Q6PEW1 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZCCHC12Q6PEW1 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZCCHC12Q6PEW1 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZCCHC12Q6PEW1 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZCCHC12Q6PEW1 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZCCHC12Q6PEW1 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZCCHC12Q6PEW1 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZCCHC12Q6PEW1 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ZCCHC12Q6PEW1 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ZCCHC12Q6PEW1 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ZCCHC12Q6PEW1 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ZCCHC12Q6PEW1 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ZCCHC12Q6PEW1 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ZCCHC12Q6PEW1 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ZCCHC12Q6PEW1 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZCCHC12Q6PEW1 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms