Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Q4

LMOD2, Leiomodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD2Q6P5Q4 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LMOD2Q6P5Q4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LMOD2Q6P5Q4 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC27.56■■■□□ 2
LMOD2Q6P5Q4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LMOD2Q6P5Q4 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LMOD2Q6P5Q4 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC27.55■■■□□ 2
LMOD2Q6P5Q4 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
LMOD2Q6P5Q4 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LMOD2Q6P5Q4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LMOD2Q6P5Q4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LMOD2Q6P5Q4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LMOD2Q6P5Q4 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LMOD2Q6P5Q4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LMOD2Q6P5Q4 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
LMOD2Q6P5Q4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
LMOD2Q6P5Q4 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
LMOD2Q6P5Q4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LMOD2Q6P5Q4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
LMOD2Q6P5Q4 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LMOD2Q6P5Q4 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
LMOD2Q6P5Q4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
LMOD2Q6P5Q4 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LMOD2Q6P5Q4 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC27.54■■■□□ 2
LMOD2Q6P5Q4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LMOD2Q6P5Q4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
LMOD2Q6P5Q4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LMOD2Q6P5Q4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
LMOD2Q6P5Q4 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
LMOD2Q6P5Q4 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LMOD2Q6P5Q4 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LMOD2Q6P5Q4 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
LMOD2Q6P5Q4 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
LMOD2Q6P5Q4 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
LMOD2Q6P5Q4 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
LMOD2Q6P5Q4 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC27.53■■■□□ 2
LMOD2Q6P5Q4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LMOD2Q6P5Q4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LMOD2Q6P5Q4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LMOD2Q6P5Q4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
LMOD2Q6P5Q4 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LMOD2Q6P5Q4 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LMOD2Q6P5Q4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LMOD2Q6P5Q4 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LMOD2Q6P5Q4 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LMOD2Q6P5Q4 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
LMOD2Q6P5Q4 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LMOD2Q6P5Q4 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
LMOD2Q6P5Q4 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
LMOD2Q6P5Q4 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LMOD2Q6P5Q4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LMOD2Q6P5Q4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LMOD2Q6P5Q4 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
LMOD2Q6P5Q4 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
LMOD2Q6P5Q4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LMOD2Q6P5Q4 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LMOD2Q6P5Q4 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LMOD2Q6P5Q4 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
LMOD2Q6P5Q4 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LMOD2Q6P5Q4 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LMOD2Q6P5Q4 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LMOD2Q6P5Q4 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LMOD2Q6P5Q4 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LMOD2Q6P5Q4 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LMOD2Q6P5Q4 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
LMOD2Q6P5Q4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LMOD2Q6P5Q4 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LMOD2Q6P5Q4 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LMOD2Q6P5Q4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LMOD2Q6P5Q4 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LMOD2Q6P5Q4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LMOD2Q6P5Q4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LMOD2Q6P5Q4 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LMOD2Q6P5Q4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LMOD2Q6P5Q4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LMOD2Q6P5Q4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LMOD2Q6P5Q4 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
LMOD2Q6P5Q4 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LMOD2Q6P5Q4 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LMOD2Q6P5Q4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LMOD2Q6P5Q4 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LMOD2Q6P5Q4 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
LMOD2Q6P5Q4 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
LMOD2Q6P5Q4 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LMOD2Q6P5Q4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LMOD2Q6P5Q4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LMOD2Q6P5Q4 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LMOD2Q6P5Q4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LMOD2Q6P5Q4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LMOD2Q6P5Q4 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LMOD2Q6P5Q4 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LMOD2Q6P5Q4 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LMOD2Q6P5Q4 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LMOD2Q6P5Q4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LMOD2Q6P5Q4 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMOD2Q6P5Q4 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMOD2Q6P5Q4 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMOD2Q6P5Q4 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
LMOD2Q6P5Q4 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMOD2Q6P5Q4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMOD2Q6P5Q4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms