Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2E9

EDC4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC4Q6P2E9 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
EDC4Q6P2E9 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
EDC4Q6P2E9 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
EDC4Q6P2E9 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EDC4Q6P2E9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EDC4Q6P2E9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EDC4Q6P2E9 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EDC4Q6P2E9 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EDC4Q6P2E9 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EDC4Q6P2E9 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EDC4Q6P2E9 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EDC4Q6P2E9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EDC4Q6P2E9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EDC4Q6P2E9 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EDC4Q6P2E9 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EDC4Q6P2E9 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EDC4Q6P2E9 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EDC4Q6P2E9 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
EDC4Q6P2E9 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EDC4Q6P2E9 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EDC4Q6P2E9 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EDC4Q6P2E9 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
EDC4Q6P2E9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EDC4Q6P2E9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EDC4Q6P2E9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EDC4Q6P2E9 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EDC4Q6P2E9 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EDC4Q6P2E9 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
EDC4Q6P2E9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
EDC4Q6P2E9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
EDC4Q6P2E9 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
EDC4Q6P2E9 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
EDC4Q6P2E9 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
EDC4Q6P2E9 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
EDC4Q6P2E9 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
EDC4Q6P2E9 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
EDC4Q6P2E9 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
EDC4Q6P2E9 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
EDC4Q6P2E9 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
EDC4Q6P2E9 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
EDC4Q6P2E9 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
EDC4Q6P2E9 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
EDC4Q6P2E9 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
EDC4Q6P2E9 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
EDC4Q6P2E9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EDC4Q6P2E9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EDC4Q6P2E9 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EDC4Q6P2E9 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EDC4Q6P2E9 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
EDC4Q6P2E9 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EDC4Q6P2E9 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
EDC4Q6P2E9 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
EDC4Q6P2E9 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
EDC4Q6P2E9 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
EDC4Q6P2E9 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EDC4Q6P2E9 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EDC4Q6P2E9 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EDC4Q6P2E9 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
EDC4Q6P2E9 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
EDC4Q6P2E9 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
EDC4Q6P2E9 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
EDC4Q6P2E9 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
EDC4Q6P2E9 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
EDC4Q6P2E9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
EDC4Q6P2E9 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
EDC4Q6P2E9 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
EDC4Q6P2E9 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
EDC4Q6P2E9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
EDC4Q6P2E9 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EDC4Q6P2E9 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
EDC4Q6P2E9 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EDC4Q6P2E9 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EDC4Q6P2E9 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
EDC4Q6P2E9 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
EDC4Q6P2E9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EDC4Q6P2E9 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EDC4Q6P2E9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
EDC4Q6P2E9 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EDC4Q6P2E9 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
EDC4Q6P2E9 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
EDC4Q6P2E9 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
EDC4Q6P2E9 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
EDC4Q6P2E9 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
EDC4Q6P2E9 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
EDC4Q6P2E9 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
EDC4Q6P2E9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
EDC4Q6P2E9 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
EDC4Q6P2E9 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
EDC4Q6P2E9 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
EDC4Q6P2E9 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
EDC4Q6P2E9 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
EDC4Q6P2E9 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
EDC4Q6P2E9 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EDC4Q6P2E9 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EDC4Q6P2E9 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EDC4Q6P2E9 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EDC4Q6P2E9 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EDC4Q6P2E9 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
EDC4Q6P2E9 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EDC4Q6P2E9 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.3 ms