Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KRT80Q6KB66 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms