Protein–RNA interactions for Protein: Q6JBY9

RCSD1, CapZ-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1Q6JBY9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RCSD1Q6JBY9 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms