Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPPQ6IPU0 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPPQ6IPU0 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPPQ6IPU0 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPPQ6IPU0 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPPQ6IPU0 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPPQ6IPU0 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPPQ6IPU0 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPPQ6IPU0 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPPQ6IPU0 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPPQ6IPU0 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPPQ6IPU0 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPPQ6IPU0 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPPQ6IPU0 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPPQ6IPU0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPPQ6IPU0 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPPQ6IPU0 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPPQ6IPU0 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPPQ6IPU0 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPPQ6IPU0 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPPQ6IPU0 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPPQ6IPU0 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPPQ6IPU0 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPPQ6IPU0 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPPQ6IPU0 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPPQ6IPU0 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPPQ6IPU0 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPPQ6IPU0 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPPQ6IPU0 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPPQ6IPU0 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPPQ6IPU0 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPPQ6IPU0 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPPQ6IPU0 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPPQ6IPU0 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPPQ6IPU0 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPPQ6IPU0 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPPQ6IPU0 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPPQ6IPU0 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPPQ6IPU0 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPPQ6IPU0 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPPQ6IPU0 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPPQ6IPU0 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPPQ6IPU0 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPPQ6IPU0 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPPQ6IPU0 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPPQ6IPU0 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPPQ6IPU0 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPPQ6IPU0 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPPQ6IPU0 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPPQ6IPU0 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPPQ6IPU0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPPQ6IPU0 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPPQ6IPU0 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CENPPQ6IPU0 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CENPPQ6IPU0 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CENPPQ6IPU0 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CENPPQ6IPU0 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CENPPQ6IPU0 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CENPPQ6IPU0 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CENPPQ6IPU0 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CENPPQ6IPU0 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CENPPQ6IPU0 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CENPPQ6IPU0 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CENPPQ6IPU0 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CENPPQ6IPU0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CENPPQ6IPU0 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CENPPQ6IPU0 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CENPPQ6IPU0 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CENPPQ6IPU0 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CENPPQ6IPU0 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CENPPQ6IPU0 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CENPPQ6IPU0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CENPPQ6IPU0 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CENPPQ6IPU0 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CENPPQ6IPU0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CENPPQ6IPU0 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CENPPQ6IPU0 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CENPPQ6IPU0 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CENPPQ6IPU0 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CENPPQ6IPU0 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CENPPQ6IPU0 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CENPPQ6IPU0 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CENPPQ6IPU0 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CENPPQ6IPU0 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CENPPQ6IPU0 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CENPPQ6IPU0 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CENPPQ6IPU0 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CENPPQ6IPU0 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CENPPQ6IPU0 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CENPPQ6IPU0 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms