Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CARMIL2Q6F5E8 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CARMIL2Q6F5E8 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CARMIL2Q6F5E8 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CARMIL2Q6F5E8 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CARMIL2Q6F5E8 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CARMIL2Q6F5E8 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CARMIL2Q6F5E8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CARMIL2Q6F5E8 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CARMIL2Q6F5E8 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CARMIL2Q6F5E8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CARMIL2Q6F5E8 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC32.2■■■□□ 2.74
CARMIL2Q6F5E8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
CARMIL2Q6F5E8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
CARMIL2Q6F5E8 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CARMIL2Q6F5E8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CARMIL2Q6F5E8 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CARMIL2Q6F5E8 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CARMIL2Q6F5E8 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CARMIL2Q6F5E8 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CARMIL2Q6F5E8 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CARMIL2Q6F5E8 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CARMIL2Q6F5E8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CARMIL2Q6F5E8 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CARMIL2Q6F5E8 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CARMIL2Q6F5E8 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CARMIL2Q6F5E8 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CARMIL2Q6F5E8 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CARMIL2Q6F5E8 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CARMIL2Q6F5E8 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CARMIL2Q6F5E8 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CARMIL2Q6F5E8 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CARMIL2Q6F5E8 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CARMIL2Q6F5E8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CARMIL2Q6F5E8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CARMIL2Q6F5E8 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CARMIL2Q6F5E8 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CARMIL2Q6F5E8 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CARMIL2Q6F5E8 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CARMIL2Q6F5E8 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CARMIL2Q6F5E8 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CARMIL2Q6F5E8 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CARMIL2Q6F5E8 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CARMIL2Q6F5E8 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CARMIL2Q6F5E8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CARMIL2Q6F5E8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CARMIL2Q6F5E8 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
CARMIL2Q6F5E8 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CARMIL2Q6F5E8 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CARMIL2Q6F5E8 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CARMIL2Q6F5E8 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CARMIL2Q6F5E8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CARMIL2Q6F5E8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CARMIL2Q6F5E8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
CARMIL2Q6F5E8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CARMIL2Q6F5E8 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CARMIL2Q6F5E8 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CARMIL2Q6F5E8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CARMIL2Q6F5E8 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CARMIL2Q6F5E8 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CARMIL2Q6F5E8 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CARMIL2Q6F5E8 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CARMIL2Q6F5E8 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CARMIL2Q6F5E8 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CARMIL2Q6F5E8 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
CARMIL2Q6F5E8 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CARMIL2Q6F5E8 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CARMIL2Q6F5E8 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CARMIL2Q6F5E8 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CARMIL2Q6F5E8 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
CARMIL2Q6F5E8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CARMIL2Q6F5E8 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CARMIL2Q6F5E8 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CARMIL2Q6F5E8 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CARMIL2Q6F5E8 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CARMIL2Q6F5E8 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CARMIL2Q6F5E8 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CARMIL2Q6F5E8 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CARMIL2Q6F5E8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CARMIL2Q6F5E8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CARMIL2Q6F5E8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CARMIL2Q6F5E8 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CARMIL2Q6F5E8 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CARMIL2Q6F5E8 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CARMIL2Q6F5E8 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CARMIL2Q6F5E8 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
CARMIL2Q6F5E8 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CARMIL2Q6F5E8 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CARMIL2Q6F5E8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CARMIL2Q6F5E8 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CARMIL2Q6F5E8 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CARMIL2Q6F5E8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CARMIL2Q6F5E8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CARMIL2Q6F5E8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CARMIL2Q6F5E8 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CARMIL2Q6F5E8 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CARMIL2Q6F5E8 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
CARMIL2Q6F5E8 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CARMIL2Q6F5E8 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CARMIL2Q6F5E8 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms