Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATL3Q6DD88 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATL3Q6DD88 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATL3Q6DD88 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATL3Q6DD88 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATL3Q6DD88 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATL3Q6DD88 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATL3Q6DD88 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATL3Q6DD88 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATL3Q6DD88 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATL3Q6DD88 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATL3Q6DD88 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATL3Q6DD88 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATL3Q6DD88 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATL3Q6DD88 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATL3Q6DD88 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATL3Q6DD88 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATL3Q6DD88 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATL3Q6DD88 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATL3Q6DD88 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATL3Q6DD88 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATL3Q6DD88 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATL3Q6DD88 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATL3Q6DD88 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATL3Q6DD88 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATL3Q6DD88 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATL3Q6DD88 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATL3Q6DD88 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATL3Q6DD88 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATL3Q6DD88 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATL3Q6DD88 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATL3Q6DD88 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATL3Q6DD88 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATL3Q6DD88 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATL3Q6DD88 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATL3Q6DD88 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATL3Q6DD88 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATL3Q6DD88 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATL3Q6DD88 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATL3Q6DD88 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATL3Q6DD88 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATL3Q6DD88 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATL3Q6DD88 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATL3Q6DD88 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATL3Q6DD88 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATL3Q6DD88 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATL3Q6DD88 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATL3Q6DD88 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATL3Q6DD88 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATL3Q6DD88 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATL3Q6DD88 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATL3Q6DD88 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATL3Q6DD88 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATL3Q6DD88 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATL3Q6DD88 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATL3Q6DD88 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATL3Q6DD88 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATL3Q6DD88 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATL3Q6DD88 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATL3Q6DD88 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATL3Q6DD88 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATL3Q6DD88 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATL3Q6DD88 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATL3Q6DD88 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATL3Q6DD88 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATL3Q6DD88 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms