Protein–RNA interactions for Protein: Q63HK3

ZKSCAN2, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 2, humanhuman

Predictions only

Length 967 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZKSCAN2Q63HK3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZKSCAN2Q63HK3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZKSCAN2Q63HK3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZKSCAN2Q63HK3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZKSCAN2Q63HK3 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZKSCAN2Q63HK3 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ZKSCAN2Q63HK3 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZKSCAN2Q63HK3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZKSCAN2Q63HK3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZKSCAN2Q63HK3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZKSCAN2Q63HK3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZKSCAN2Q63HK3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZKSCAN2Q63HK3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZKSCAN2Q63HK3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZKSCAN2Q63HK3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ZKSCAN2Q63HK3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZKSCAN2Q63HK3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZKSCAN2Q63HK3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZKSCAN2Q63HK3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZKSCAN2Q63HK3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZKSCAN2Q63HK3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZKSCAN2Q63HK3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ZKSCAN2Q63HK3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZKSCAN2Q63HK3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZKSCAN2Q63HK3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZKSCAN2Q63HK3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZKSCAN2Q63HK3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZKSCAN2Q63HK3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZKSCAN2Q63HK3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZKSCAN2Q63HK3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZKSCAN2Q63HK3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZKSCAN2Q63HK3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZKSCAN2Q63HK3 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZKSCAN2Q63HK3 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZKSCAN2Q63HK3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZKSCAN2Q63HK3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZKSCAN2Q63HK3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZKSCAN2Q63HK3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZKSCAN2Q63HK3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZKSCAN2Q63HK3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZKSCAN2Q63HK3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZKSCAN2Q63HK3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZKSCAN2Q63HK3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZKSCAN2Q63HK3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZKSCAN2Q63HK3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZKSCAN2Q63HK3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZKSCAN2Q63HK3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZKSCAN2Q63HK3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZKSCAN2Q63HK3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZKSCAN2Q63HK3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZKSCAN2Q63HK3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZKSCAN2Q63HK3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZKSCAN2Q63HK3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZKSCAN2Q63HK3 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZKSCAN2Q63HK3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZKSCAN2Q63HK3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZKSCAN2Q63HK3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZKSCAN2Q63HK3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZKSCAN2Q63HK3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZKSCAN2Q63HK3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZKSCAN2Q63HK3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZKSCAN2Q63HK3 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZKSCAN2Q63HK3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ZKSCAN2Q63HK3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZKSCAN2Q63HK3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZKSCAN2Q63HK3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZKSCAN2Q63HK3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZKSCAN2Q63HK3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZKSCAN2Q63HK3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZKSCAN2Q63HK3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZKSCAN2Q63HK3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZKSCAN2Q63HK3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZKSCAN2Q63HK3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZKSCAN2Q63HK3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZKSCAN2Q63HK3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZKSCAN2Q63HK3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZKSCAN2Q63HK3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZKSCAN2Q63HK3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZKSCAN2Q63HK3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZKSCAN2Q63HK3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZKSCAN2Q63HK3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZKSCAN2Q63HK3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZKSCAN2Q63HK3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZKSCAN2Q63HK3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZKSCAN2Q63HK3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZKSCAN2Q63HK3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZKSCAN2Q63HK3 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZKSCAN2Q63HK3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZKSCAN2Q63HK3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZKSCAN2Q63HK3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZKSCAN2Q63HK3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZKSCAN2Q63HK3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZKSCAN2Q63HK3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ZKSCAN2Q63HK3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ZKSCAN2Q63HK3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZKSCAN2Q63HK3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZKSCAN2Q63HK3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZKSCAN2Q63HK3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZKSCAN2Q63HK3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZKSCAN2Q63HK3 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms