Protein–RNA interactions for Protein: Q60I27

ALS2CL, ALS2 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CLQ60I27 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms