Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CARMIL1Q5VZK9 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CARMIL1Q5VZK9 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CARMIL1Q5VZK9 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CARMIL1Q5VZK9 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CARMIL1Q5VZK9 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CARMIL1Q5VZK9 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
CARMIL1Q5VZK9 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CARMIL1Q5VZK9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CARMIL1Q5VZK9 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CARMIL1Q5VZK9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CARMIL1Q5VZK9 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CARMIL1Q5VZK9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CARMIL1Q5VZK9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CARMIL1Q5VZK9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CARMIL1Q5VZK9 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CARMIL1Q5VZK9 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CARMIL1Q5VZK9 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CARMIL1Q5VZK9 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CARMIL1Q5VZK9 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CARMIL1Q5VZK9 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CARMIL1Q5VZK9 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
CARMIL1Q5VZK9 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CARMIL1Q5VZK9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CARMIL1Q5VZK9 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CARMIL1Q5VZK9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CARMIL1Q5VZK9 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CARMIL1Q5VZK9 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CARMIL1Q5VZK9 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CARMIL1Q5VZK9 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CARMIL1Q5VZK9 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CARMIL1Q5VZK9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CARMIL1Q5VZK9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CARMIL1Q5VZK9 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CARMIL1Q5VZK9 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CARMIL1Q5VZK9 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CARMIL1Q5VZK9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CARMIL1Q5VZK9 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CARMIL1Q5VZK9 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
CARMIL1Q5VZK9 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CARMIL1Q5VZK9 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CARMIL1Q5VZK9 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CARMIL1Q5VZK9 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CARMIL1Q5VZK9 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CARMIL1Q5VZK9 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CARMIL1Q5VZK9 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CARMIL1Q5VZK9 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
CARMIL1Q5VZK9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
CARMIL1Q5VZK9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
CARMIL1Q5VZK9 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
CARMIL1Q5VZK9 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.88
CARMIL1Q5VZK9 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
CARMIL1Q5VZK9 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.88
CARMIL1Q5VZK9 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
CARMIL1Q5VZK9 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
CARMIL1Q5VZK9 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
CARMIL1Q5VZK9 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
CARMIL1Q5VZK9 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
CARMIL1Q5VZK9 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
CARMIL1Q5VZK9 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
CARMIL1Q5VZK9 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
CARMIL1Q5VZK9 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
CARMIL1Q5VZK9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
CARMIL1Q5VZK9 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
CARMIL1Q5VZK9 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
CARMIL1Q5VZK9 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
CARMIL1Q5VZK9 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
CARMIL1Q5VZK9 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
CARMIL1Q5VZK9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CARMIL1Q5VZK9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CARMIL1Q5VZK9 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
CARMIL1Q5VZK9 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC32.99■■■□□ 2.87
CARMIL1Q5VZK9 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
CARMIL1Q5VZK9 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CARMIL1Q5VZK9 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
CARMIL1Q5VZK9 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CARMIL1Q5VZK9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CARMIL1Q5VZK9 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
CARMIL1Q5VZK9 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CARMIL1Q5VZK9 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CARMIL1Q5VZK9 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
CARMIL1Q5VZK9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CARMIL1Q5VZK9 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
CARMIL1Q5VZK9 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
CARMIL1Q5VZK9 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
CARMIL1Q5VZK9 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
CARMIL1Q5VZK9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CARMIL1Q5VZK9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CARMIL1Q5VZK9 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
CARMIL1Q5VZK9 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CARMIL1Q5VZK9 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CARMIL1Q5VZK9 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
CARMIL1Q5VZK9 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CARMIL1Q5VZK9 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CARMIL1Q5VZK9 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
CARMIL1Q5VZK9 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
CARMIL1Q5VZK9 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
CARMIL1Q5VZK9 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
CARMIL1Q5VZK9 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
CARMIL1Q5VZK9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms