Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAMD13Q5VXD3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD13Q5VXD3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms