Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUE5

C1orf53, Uncharacterized protein C1orf53, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf53Q5VUE5 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
C1orf53Q5VUE5 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
C1orf53Q5VUE5 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1orf53Q5VUE5 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1orf53Q5VUE5 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1orf53Q5VUE5 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1orf53Q5VUE5 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
C1orf53Q5VUE5 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1orf53Q5VUE5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1orf53Q5VUE5 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1orf53Q5VUE5 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1orf53Q5VUE5 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1orf53Q5VUE5 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1orf53Q5VUE5 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1orf53Q5VUE5 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1orf53Q5VUE5 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
C1orf53Q5VUE5 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1orf53Q5VUE5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1orf53Q5VUE5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1orf53Q5VUE5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1orf53Q5VUE5 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1orf53Q5VUE5 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1orf53Q5VUE5 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1orf53Q5VUE5 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1orf53Q5VUE5 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1orf53Q5VUE5 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1orf53Q5VUE5 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1orf53Q5VUE5 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1orf53Q5VUE5 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1orf53Q5VUE5 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
C1orf53Q5VUE5 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1orf53Q5VUE5 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1orf53Q5VUE5 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1orf53Q5VUE5 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1orf53Q5VUE5 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1orf53Q5VUE5 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1orf53Q5VUE5 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1orf53Q5VUE5 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
C1orf53Q5VUE5 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1orf53Q5VUE5 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
C1orf53Q5VUE5 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1orf53Q5VUE5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1orf53Q5VUE5 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1orf53Q5VUE5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1orf53Q5VUE5 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1orf53Q5VUE5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1orf53Q5VUE5 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1orf53Q5VUE5 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1orf53Q5VUE5 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
C1orf53Q5VUE5 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1orf53Q5VUE5 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1orf53Q5VUE5 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1orf53Q5VUE5 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
C1orf53Q5VUE5 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
C1orf53Q5VUE5 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1orf53Q5VUE5 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
C1orf53Q5VUE5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
C1orf53Q5VUE5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1orf53Q5VUE5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1orf53Q5VUE5 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1orf53Q5VUE5 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1orf53Q5VUE5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1orf53Q5VUE5 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1orf53Q5VUE5 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
C1orf53Q5VUE5 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1orf53Q5VUE5 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1orf53Q5VUE5 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1orf53Q5VUE5 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1orf53Q5VUE5 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1orf53Q5VUE5 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1orf53Q5VUE5 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1orf53Q5VUE5 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1orf53Q5VUE5 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1orf53Q5VUE5 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
C1orf53Q5VUE5 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1orf53Q5VUE5 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1orf53Q5VUE5 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1orf53Q5VUE5 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
C1orf53Q5VUE5 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1orf53Q5VUE5 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1orf53Q5VUE5 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1orf53Q5VUE5 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
C1orf53Q5VUE5 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C1orf53Q5VUE5 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
C1orf53Q5VUE5 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
C1orf53Q5VUE5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C1orf53Q5VUE5 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
C1orf53Q5VUE5 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms