Protein–RNA interactions for Protein: Q58F21

BRDT, Bromodomain testis-specific protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRDTQ58F21 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
BRDTQ58F21 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRDTQ58F21 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRDTQ58F21 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRDTQ58F21 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRDTQ58F21 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRDTQ58F21 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRDTQ58F21 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRDTQ58F21 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRDTQ58F21 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRDTQ58F21 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRDTQ58F21 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms