Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms