Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CTXN3Q4LDR2 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTXN3Q4LDR2 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTXN3Q4LDR2 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTXN3Q4LDR2 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTXN3Q4LDR2 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTXN3Q4LDR2 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CTXN3Q4LDR2 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTXN3Q4LDR2 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTXN3Q4LDR2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CTXN3Q4LDR2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CTXN3Q4LDR2 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTXN3Q4LDR2 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTXN3Q4LDR2 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTXN3Q4LDR2 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTXN3Q4LDR2 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTXN3Q4LDR2 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTXN3Q4LDR2 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTXN3Q4LDR2 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTXN3Q4LDR2 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTXN3Q4LDR2 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTXN3Q4LDR2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTXN3Q4LDR2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTXN3Q4LDR2 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTXN3Q4LDR2 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTXN3Q4LDR2 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTXN3Q4LDR2 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTXN3Q4LDR2 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTXN3Q4LDR2 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTXN3Q4LDR2 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTXN3Q4LDR2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTXN3Q4LDR2 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTXN3Q4LDR2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTXN3Q4LDR2 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTXN3Q4LDR2 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTXN3Q4LDR2 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTXN3Q4LDR2 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTXN3Q4LDR2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTXN3Q4LDR2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTXN3Q4LDR2 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTXN3Q4LDR2 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTXN3Q4LDR2 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CTXN3Q4LDR2 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CTXN3Q4LDR2 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTXN3Q4LDR2 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTXN3Q4LDR2 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTXN3Q4LDR2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTXN3Q4LDR2 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTXN3Q4LDR2 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTXN3Q4LDR2 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTXN3Q4LDR2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTXN3Q4LDR2 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTXN3Q4LDR2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTXN3Q4LDR2 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTXN3Q4LDR2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTXN3Q4LDR2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTXN3Q4LDR2 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTXN3Q4LDR2 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTXN3Q4LDR2 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTXN3Q4LDR2 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTXN3Q4LDR2 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTXN3Q4LDR2 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTXN3Q4LDR2 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CTXN3Q4LDR2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTXN3Q4LDR2 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTXN3Q4LDR2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CTXN3Q4LDR2 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTXN3Q4LDR2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTXN3Q4LDR2 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTXN3Q4LDR2 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTXN3Q4LDR2 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTXN3Q4LDR2 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTXN3Q4LDR2 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTXN3Q4LDR2 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTXN3Q4LDR2 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTXN3Q4LDR2 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTXN3Q4LDR2 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTXN3Q4LDR2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTXN3Q4LDR2 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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