Protein–RNA interactions for Protein: Q3C1V8

BSX, Brain-specific homeobox protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BSXQ3C1V8 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
BSXQ3C1V8 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BSXQ3C1V8 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
BSXQ3C1V8 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BSXQ3C1V8 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BSXQ3C1V8 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BSXQ3C1V8 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BSXQ3C1V8 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BSXQ3C1V8 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BSXQ3C1V8 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BSXQ3C1V8 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BSXQ3C1V8 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BSXQ3C1V8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BSXQ3C1V8 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BSXQ3C1V8 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BSXQ3C1V8 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BSXQ3C1V8 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BSXQ3C1V8 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BSXQ3C1V8 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BSXQ3C1V8 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BSXQ3C1V8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BSXQ3C1V8 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BSXQ3C1V8 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BSXQ3C1V8 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BSXQ3C1V8 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BSXQ3C1V8 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BSXQ3C1V8 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BSXQ3C1V8 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BSXQ3C1V8 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BSXQ3C1V8 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BSXQ3C1V8 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BSXQ3C1V8 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BSXQ3C1V8 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BSXQ3C1V8 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BSXQ3C1V8 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BSXQ3C1V8 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BSXQ3C1V8 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BSXQ3C1V8 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BSXQ3C1V8 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BSXQ3C1V8 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BSXQ3C1V8 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BSXQ3C1V8 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BSXQ3C1V8 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BSXQ3C1V8 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BSXQ3C1V8 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BSXQ3C1V8 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
BSXQ3C1V8 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BSXQ3C1V8 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BSXQ3C1V8 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BSXQ3C1V8 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BSXQ3C1V8 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BSXQ3C1V8 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BSXQ3C1V8 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BSXQ3C1V8 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BSXQ3C1V8 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BSXQ3C1V8 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BSXQ3C1V8 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BSXQ3C1V8 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BSXQ3C1V8 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BSXQ3C1V8 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BSXQ3C1V8 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BSXQ3C1V8 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BSXQ3C1V8 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BSXQ3C1V8 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BSXQ3C1V8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BSXQ3C1V8 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BSXQ3C1V8 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BSXQ3C1V8 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BSXQ3C1V8 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BSXQ3C1V8 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BSXQ3C1V8 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BSXQ3C1V8 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BSXQ3C1V8 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BSXQ3C1V8 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BSXQ3C1V8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BSXQ3C1V8 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BSXQ3C1V8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BSXQ3C1V8 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BSXQ3C1V8 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BSXQ3C1V8 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BSXQ3C1V8 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BSXQ3C1V8 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BSXQ3C1V8 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BSXQ3C1V8 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BSXQ3C1V8 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BSXQ3C1V8 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BSXQ3C1V8 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BSXQ3C1V8 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BSXQ3C1V8 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BSXQ3C1V8 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BSXQ3C1V8 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BSXQ3C1V8 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BSXQ3C1V8 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BSXQ3C1V8 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BSXQ3C1V8 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BSXQ3C1V8 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BSXQ3C1V8 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BSXQ3C1V8 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BSXQ3C1V8 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BSXQ3C1V8 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms