Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
COL24A1Q17RW2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
COL24A1Q17RW2 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
COL24A1Q17RW2 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
COL24A1Q17RW2 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
COL24A1Q17RW2 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
COL24A1Q17RW2 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
COL24A1Q17RW2 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
COL24A1Q17RW2 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
COL24A1Q17RW2 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
COL24A1Q17RW2 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
COL24A1Q17RW2 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
COL24A1Q17RW2 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
COL24A1Q17RW2 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
COL24A1Q17RW2 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
COL24A1Q17RW2 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
COL24A1Q17RW2 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
COL24A1Q17RW2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
COL24A1Q17RW2 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
COL24A1Q17RW2 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
COL24A1Q17RW2 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
COL24A1Q17RW2 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
COL24A1Q17RW2 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
COL24A1Q17RW2 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
COL24A1Q17RW2 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
COL24A1Q17RW2 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
COL24A1Q17RW2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
COL24A1Q17RW2 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
COL24A1Q17RW2 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
COL24A1Q17RW2 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
COL24A1Q17RW2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
COL24A1Q17RW2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
COL24A1Q17RW2 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
COL24A1Q17RW2 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
COL24A1Q17RW2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
COL24A1Q17RW2 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
COL24A1Q17RW2 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
COL24A1Q17RW2 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
COL24A1Q17RW2 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
COL24A1Q17RW2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
COL24A1Q17RW2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
COL24A1Q17RW2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
COL24A1Q17RW2 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
COL24A1Q17RW2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
COL24A1Q17RW2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
COL24A1Q17RW2 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
COL24A1Q17RW2 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
COL24A1Q17RW2 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
COL24A1Q17RW2 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
COL24A1Q17RW2 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
COL24A1Q17RW2 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
COL24A1Q17RW2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
COL24A1Q17RW2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
COL24A1Q17RW2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
COL24A1Q17RW2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
COL24A1Q17RW2 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
COL24A1Q17RW2 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
COL24A1Q17RW2 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
COL24A1Q17RW2 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
COL24A1Q17RW2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
COL24A1Q17RW2 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
COL24A1Q17RW2 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
COL24A1Q17RW2 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
COL24A1Q17RW2 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
COL24A1Q17RW2 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
COL24A1Q17RW2 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
COL24A1Q17RW2 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
COL24A1Q17RW2 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
COL24A1Q17RW2 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
COL24A1Q17RW2 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
COL24A1Q17RW2 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
COL24A1Q17RW2 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
COL24A1Q17RW2 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
COL24A1Q17RW2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
COL24A1Q17RW2 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
COL24A1Q17RW2 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
COL24A1Q17RW2 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
COL24A1Q17RW2 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
COL24A1Q17RW2 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
COL24A1Q17RW2 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
COL24A1Q17RW2 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
COL24A1Q17RW2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
COL24A1Q17RW2 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
COL24A1Q17RW2 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
COL24A1Q17RW2 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
COL24A1Q17RW2 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
COL24A1Q17RW2 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
COL24A1Q17RW2 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
COL24A1Q17RW2 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
COL24A1Q17RW2 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
COL24A1Q17RW2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
COL24A1Q17RW2 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
COL24A1Q17RW2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
COL24A1Q17RW2 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
COL24A1Q17RW2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
COL24A1Q17RW2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
COL24A1Q17RW2 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
COL24A1Q17RW2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
COL24A1Q17RW2 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
COL24A1Q17RW2 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms